00 CAMPUS ARISTÓTELES CALAZANS SIMÕES (CAMPUS A. C. SIMÕES) ICBS - INSTITUTO DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS E DA SAÚDE Dissertações e Teses defendidas na UFAL - ICBS
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Campo DCValorIdioma
dc.contributor.advisor1Andrade, Tiago Gomes de-
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/0995435972741771pt_BR
dc.contributor.referee1Sarmento, Felipe José de Queiroz-
dc.contributor.referee1Latteshttp://lattes.cnpq.br/5318073594804973pt_BR
dc.contributor.referee2Cavalcante, Rodolfo Carneiro-
dc.contributor.referee2Latteshttp://lattes.cnpq.br/0181615416246917pt_BR
dc.contributor.referee3Silva, Aline Cristine Pereira e-
dc.contributor.referee3Latteshttp://lattes.cnpq.br/1973383979749328pt_BR
dc.creatorFigueredo, Diego de Siqueira-
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/3634074128661100pt_BR
dc.date.accessioned2018-11-07T15:19:57Z-
dc.date.available2018-11-07-
dc.date.available2018-11-07T15:19:57Z-
dc.date.issued2018-09-25-
dc.identifier.citationFIGUEIREDO, Diego de Siqueira. Estudo de microRNAs relacionados a ritmos circadianos: identificação e validação de candidatos, perfil transcriptômico e impacto na normalização de ensaios de expressão gênica. 2018. 103 f. Tese (Doutorado em Ciências da Saúde) – Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde, Programa de Pós Graduação em Ciências da Saúde, Universidade Federal de Alagoas, Maceió, 2018.pt_BR
dc.identifier.urihttp://www.repositorio.ufal.br/handle/riufal/3540-
dc.description.sponsorshipFAPEAL - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Alagoaspt_BR
dc.languageporpt_BR
dc.publisherUniversidade Federal de Alagoaspt_BR
dc.publisher.countryBrasilpt_BR
dc.publisher.programPrograma de Pós-Graduação em Ciências da Saúdept_BR
dc.publisher.initialsUFALpt_BR
dc.rightsAcesso Abertopt_BR
dc.subjectRitmos circadianospt_BR
dc.subjectmiRNAspt_BR
dc.subjectGenes relógiopt_BR
dc.subjectGenes de referenciapt_BR
dc.subjectBioinformáticapt_BR
dc.subjectCircadian rhythmspt_BR
dc.subjectGenes watchpt_BR
dc.subjectReference genespt_BR
dc.subjectBioinformaticspt_BR
dc.subject.cnpqCNPQ::CIENCIAS DA SAUDEpt_BR
dc.titleEstudo de microRNAs relacionados a ritmos circadianos: identificação e validação de candidatos, perfil transcriptômico e impacto na normalização de ensaios de expressão gênicapt_BR
dc.title.alternativeStudy of microRNAs related to circadian rhythms: identification and validation of candidates, transcriptomic profile and impacto n the normalization of gene expression assayspt_BR
dc.typeTesept_BR
dc.description.resumoEstima-se que 50% dos genes codificadores de proteínas possuem oscilação rítmica em diferentes tecidos de mamíferos. Curiosamente, metade das proteínas desses genes possuem seus RNAm correspondentes com expressão constitutiva (arrítmica), ressaltando a relevância de eventos pós-transcricionais para a oscilação de proteínas. Os “High throughput Assays” (HTA) circadianos são extremamente importantes, pois fornecem informações acerca da expressão de milhares de transcritos e de proteínas, uma rica coleção cronobiológica que pode ajudar na resolução de diferentes problemas científicos, não apenas os abordados nas pesquisas originais. Embora altamente reprodutivos e informativos, ensaios de biologia molecular circadiana apresentam algumas divergências em seus resultados, ressaltando a necessidade do aprimoramento de métodos de normalização e análise dos diferentes ensaios de expressão. Até o momento, não se conhecem os impactos da normalização do RNA em ensaios de expressão de pequenos RNAs, como miRNAs. Este estudo objetivou: (1) analisar a co-expressão de miRNAs e RNAm e proteínas de genes alvos; (2) identificar e validar miRNAs candidatos ao sistema molecular circadiano; (3) analisar o impacto da normalização do RNA total em estudos circadianos de miRNAs. Através da sistematização de diferentes dados circadianos de HTA (RNA-seq, small RNA-seq, Chip-seq e proteoma), de bioinformática e de interações miRNA:RNAm validadas, identificamos uma lista de 152 microRNAs (miRNAs) candidatos ao controle pós-transcricional dos ritmos moleculares. Desses, os dois mais relevantes, miR29b-3p e miR-23b-3p, foram experimentalmente validados como importantes para a manutenção do período dos ritmos das células U2OS PER2:LUC. Análises de HTA também permitiram a identificação de diferenças nas fases de expressão de miRNAs 3p e 5p, com genes alvos divergentes. Interessantemente, a identificação de padrões de expressão de RNAm e proteínas de genes alvos de miRNAs, permite sugerir um mecanismo de ajuste das amplitudes dos ritmos das proteínas dependente da fase do RNAm. Por fim, através do controle de etapas experimentais, demonstramos oscilação circadiana na concentração do RNA total de diferentes regiões de cérebros de camundongos. A normalização desse ritmo, durante a síntese de cDNA, afeta o perfil de expressão de transcritos, incluindo os dos genes relógio Per1-2 e Bmal1. Ademais, através de análises com RNA exógeno, ou spike-ins, demonstramos que o ajuste da concentração do RNA compromete a análise de miRNAs, possivelmente por interferências nos rendimentos de extração e nas reações de síntese de cDNA. Este estudo apresenta dois novos miRNAs importantes para a manutenção da ritmicidade circadiana e uma nova estratégia de análise de qPCR para estudos cronobiológicos de miRNAs.pt_BR
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Estudo de microRNAs relacionados a ritmos circadianos identificação e validação de candidatos, perfil transcriptômico e impacto na normalização de ensaios de expressão gênica.pdfEstudo de microRNAs relacionados a ritmos circadianos: identificação e validação de candidatos, perfil transcriptômico e impacto na normalização de ensaios de expressão gênica13.63 MBAdobe PDFVisualizar/Abrir
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