1) As PRODUÇÕES ACADÊMICAS deverão ser encaminhadas em formato PDF, desbloqueado para seleção e cópia de texto, para o e-mail ri@sibi.ufal.br, juntamente com o Termo de Autorização para a Publicação (assinado).
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3) O TERMO DE AUTORIZAÇÃO PARA PUBLICAÇÃO deverá estar preenchido de acordo com o tipo de produção, assinado pelo(a) autor(a), e enviado por e-mail juntamente com o trabalho acadêmico.
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http://www.repositorio.ufal.br/jspui/handle/riufal/190| Tipo: | Dissertação |
| Título: | Análise in silico em ESTs de cana-de-açúcar (Saccharum officinarum) relacionados à resistência ao estresse hídrico |
| Autor(es): | Sales, Janice Silva |
| Primeiro Orientador: | Ramalho Neto, Cicero Eduardo |
| metadata.dc.contributor.referee1: | Silva, Denise Maria Wanderlei |
| metadata.dc.contributor.referee2: | Souza, Onaldo |
| metadata.dc.contributor.referee3: | Amorim, Edna Peixoto da Rocha |
| Resumo: | Etiquetas de seqüências expressas geradas pelo Projeto ESTs de cana-de-açúcar (FAPESP) forneceram um banco de dados útil para a investigação das seqüências de DNA relacionadas a muitas características agroindustriais da cana-de-açúcar. Quando comparadas às seqüências de DNA de diversas espécies de plantas disponíveis no banco de dados do Centro Nacional de Informação Biotecnológica (NCBI), foi possível avaliar várias proteínas produzidas por esta planta, incluindo aquelas relacionadas à resistência ao estresse hídrico. O SUCEST gerou aproximadamente 43.150 clusters de onde foram obtidas 52 proteínas putativas relacionadas à resistência ao estresse hídrico em 2.998 clusters analisados. A identificação de proteínas in silico teve como suporte um protocolo modificado desenvolvido pelo SUCEST, que usou ferramentas de bioinformática específicas, disponíveis no NCBI, como por exemplo BLAST e FASTA. |
| Abstract: | The expressed sequenced tags (ESTs) generated by Sugarcane ESTs Project (FAPESP) provided a useful databank for the investigation of DNA sequences related to many different sugarcane agroindustrial features. When compared to DNA sequences from several plant species available at The National Center for Biotechnology Information Databank it was possible to perform a survey on various proteins produced by this plant including those related to water stress resistance. SUCEST generated approximately 43,150 clusters from where 52 best hits were obtained in this survey for putative proteins related to water stress resistance on 2,998 analyzed clusters. In silico protein identification was achieved following a modified protocol developed by SUCEST which used specific bioinformatics tools available at NCBi such as BLAST and FASTA. |
| Palavras-chave: | ESTs Sugarcane Water stress ESTs ana-de-açúcar Estresse hídrico |
| CNPq: | CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMIA |
| Idioma: | por |
| País: | BR |
| Editor: | Universidade Federal de Alagoas |
| Sigla da Instituição: | UFAL |
| metadata.dc.publisher.program: | Programa de Pós-Graduação em Agronomia |
| Citação: | SALES, Janice Silva. Análise in silico em ESTs de cana-de-açúcar (Saccharum officinarum) relacionados à resistência ao estresse hídrico. 2006. 109 f. Dissertação (Mestrado em Agronomia: Produção vegetal) - Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós Graduação em Agronomia, Universidade Federal de Alagoas, Rio Largo, 2006. |
| Tipo de Acesso: | Acesso Aberto |
| URI: | http://repositorio.ufal.br/handle/riufal/190 |
| Data do documento: | 26-jul-2006 |
| Aparece nas coleções: | Dissertações e Teses defendidas na UFAL - CECA |
| Arquivo | Descrição | Tamanho | Formato | |
|---|---|---|---|---|
| Análise in silico em ESTs de cana-de-açúcar (Saccharum officinarum) relacionados à resistência ao estresse hídrico.pdf | 3.23 MB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |
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